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國家基因組科學數據中心發布數據資源整合挖掘體系

  

    近日,國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research在線發表題爲“Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020的文章,以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建設方面的布局與現狀。 

  國家基因組科學數據中心依托中科院北京基因组研究所建设,由中科院生物物理所和上海营养健康所共建。在前期数据资源建设基础之上,从数据、信息、知识三个层次系统展示了面向人口健康和重要战略生物资源的生物大数据汇交共享平台和多层次资源体系。此次,國家基因組科學數據中心发布了基因组变异与表型关联、微生物分类与基因组资源、表观组关联分析、特色物种多维组学信息资源等8個新開發數據庫,系統更新了原始測序數據歸檔庫GSA、基因組歸檔數據庫GWH、基因組變異數據庫GVM、非編碼RNA15個資源庫,並對雲分析等4個網絡服務工具進行了更新優化。 

  國家基因組科學數據中心免费向国内外用户提供方便快捷的多组学数据汇交和存储服务,目前,已汇交来自269個單位720個用戶遞交的超過1.4PB的組學數據,相關數據發表于144種國內外期刊的237篇文章。GSA已被國際著名出版商Elsevier收錄爲指定的基因數據歸檔庫。此外,通過跨庫檢索形式,中心還整合了13家國內合作科研機構的25個專業特色數據庫,極大豐富了數據資源類型。 

  该研究得到科技部、中國科學院、国际生物科学联合会等的资助。 

  國家基因組科學數據中心核心数据资源 

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